1)Скачиваем плагин(архив с плагином) и распаковываем в любую папку, если архив.
2) Копируем файл с расширением amxx (в нашем случае antiflood.amxx) в папку *\cstrike\addons\amxmodx\plugins\
3) Идем в *\cstrike\addons\amxmodx\configs\ и открываем файл plugins.ini
4)В конец файла вписываем название плагина(вместе с расширением) (у нас это antiflood.amxx) , сохраняем и закрываем файл.
5) Перезапускаем сервер или меняем карту на сервере (Если он запущен)
На этом установка закончена.